La biblioteca dell’IIM, aperta al pubblico su appuntamento, vanta un patrimonio librario di circa 20.000 volumi. Vi sono conservati circa 350 periodici specialistici, circa 250 tra portolani ed atlanti geografici, meteorologici ed oceanografici e oltre 200 resoconti di viaggi e spedizioni scientifiche pubblicati dalla seconda metà del Settecento in poi. Pregevole è la raccolta di oltre 2000 documenti tra carte sciolte, portolani e atlanti pubblicati tra la fine del Seicento e il primo Novecento da enti cartografici stranieri e preunitari. La biblioteca comprende inoltre un migliaio carte a stampa dei fiumi russi, molto rare, che risalgono al primo Novecento.
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